জাতীয় রাজস্ব বোর্ডের আওতাধীন কাস্টমস এক্সাইজ ও ভ্যাট কমিশনারেট, সিলেট বিগত ২০০০খ্রিঃ সনের নভেম্বর মাস হতে তৎকালীন চট্টগ্রাম কালেক্টরেট হতে পৃথক হয়ে কার্যক্রম শুরু করে। সিলেট প্রশাসনিক বিভাগের সমগ্র ভৌগোলিক এলাকা নিয়ে এই কমিশনারেট এর অধিক্ষেত্র। এ কমিশনারেটের অধীন স্থানীয় পর্যায়ে মূল্য সংযোজন কর ও আমদানী পর্যায়ে শুল্ক করাদি আদায়ের জন্য কাস্টমস ও ভ্যাট উইং এ ০৬ (ছয়) টি বিভাগীয় দপ্তর, ১২ (বারো) টি ভ্যাট সার্কেল অফিস এবং ১৩ (তেরো) টি স্থল শুল্ক স্টেশন রয়েছে।
এক নজরে কমিশনারেটের অধীক্ষেত্রাধীন দপ্তরসমূহঃ
ভ্যাট উইং
১. আবগারী ও ভ্যাট বিভাগ, সিলেট।
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, সিলেট-১
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, সিলেট-২
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, সিলেট-৩
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, সিলেট-৪
২. আবগারী ও ভ্যাট বিভাগ, মৌলভীবাজার।
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, মৌলভীবাজার
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, কুলাউড়া
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, শ্রীমঙ্গল
৩. আবগারী ও ভ্যাট বিভাগ, হবিগঞ্জ।
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, হবিগঞ্জ-১
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, হবিগঞ্জ-২
৪. আবগারী ও ভ্যাট বিভাগ, সুনামগঞ্জ।
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, সুনামগঞ্জ উত্তর
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, সুনামগঞ্জ দক্ষিণ
- আবগারী ও ভ্যাট সার্কেল, ছাতক
কাস্টমস উইং
১. ওসমানী আন্তর্জাতিক বিমানবন্দর ও এয়ারফ্রেইট বিভাগ, সিলেট।
২. কাস্টমস বিভাগ, জিন্দাবাজার, সিলেট।
- তামাবিল স্থল শুল্ক স্টেশন, গোয়াইনঘাট
- জকিগঞ্জ স্থল শুল্ক স্টেশন, জকিগঞ্জ
- শেওলা স্থল শুল্ক স্টেশন, বিয়ানীবাজার
- চাতলাপুর স্থল শুল্ক স্টেশন, শমসেরনগর, কুলাউড়া
- জুড়ি (বেতুলি) স্থল শুল্ক স্টেশন, জুড়ি
- ভোলাগঞ্জ স্থল শুল্ক স্টেশন, ভোলাগঞ্জ
- বাল্লা স্থল শুল্ক স্টেশন, হবিগঞ্জ
- ছাতক স্থল শুল্ক স্টেশন, ছাতক
- চেলা স্থল শুল্ক স্টেশন, ছাতক
- ইছামতি স্থল শুল্ক স্টেশন, ছাতক
- বড়ছড়া স্থল শুল্ক স্টেশন, তাহিরপুর
- বাগলি স্থল শুল্ক স্টেশন, তাহিরপুর
- চারাগাঁও স্থল শুল্ক স্টেশন, তাহিরপুর